L'annexe I de la Directive Oiseaux liste les espèces d’oiseaux d'intérêt communautaire, c’est-à-dire les espèces qui sont soit :
en danger d'extinction
vulnérables, pour les espèces qui ne sont pas encore en danger mais qui peuvent le devenir dans un avenir proche si les pressions qu'elles subissent ne diminuent pas
rares, lorsqu'elles présentent des populations de petite taille et ne sont pas encore en danger ou vulnérables, qui peuvent le devenir
endémiques, lorsqu'elles sont caractéristiques d'une zone géographique restreinte particulière, et strictement localisées à cette zone, du fait de la spécificité de leur habitat.
On distingue les espèces prioritaires, c'est-à-dire celles dont l'état de conservation est préoccupant et pour lesquelles un effort particulier doit être engagé.
Sur le site de la Colle du Rouet, 21 espèces de l’annexe 1 de la « Directive Oiseaux » sont présentes sur le site Natura 2000, 13 EMR (espèces migratrices régulières) et 9 autres espèces importantes.
Oiseaux de l’annexe 1 de la directive « Oiseaux » présents sur le site :
Les descriptions et analyses de chaque oiseaux d’intérêt communautaire recensée sur le site figurent dans les fiches « oiseaux » ci-dessous :
Aigle royal : 
Fiche descriptive
Aigle de bonelli : Fiche descriptive
Aigrette garzette : Fiche descriptive
Alouette lulu : Fiche descriptive
Autour des palombes : Fiche descriptive
Bécasse des bois : Fiche descriptive
Bécassine des marais : Fiche descriptive
Bihoreau gris : Fiche descriptive
Blongios nain : Fiche descriptive
Bondrée apivore : Fiche descriptive
Bruant ortolan : Fiche descriptive
Caille des blés : Fiche descriptive
Circaète Jean-le-blanc : Fiche descriptive
Crabier chevelu : Fiche descriptive
Engoulevent d’Europe : Fiche descriptive
Faucon hobereau : Fiche descriptive
Faucon pèlerin : Fiche descriptive
Fauvette passerinette : Fiche descriptive
Fauvette pitchou : Fiche descriptive
Grand Cormoran : Fiche descriptive
Grand-duc d’Europe : Fiche descriptive
Guêpier d’Europe : Fiche descriptive
Héron pourpré : Fiche descriptive
Hirondelle de rivage : Fiche descriptive
Hirondelle rousseline : Fiche descriptive
Martin-pêcheur d’Europe : Fiche descriptive
Milan noir : Fiche descriptive
Milan royal : Fiche descriptive
Petit Gravelot : Fiche descriptive
Pic noir : Fiche descriptive
Pie-grièche à tête rousse : Fiche descriptive
Pie-grièche écorcheur : Fiche descriptive
Pipit rousseline : Fiche descriptive
Rollier d’Europe : Fiche descriptive
Sarcelle d’hiver : Fiche descriptive
Torcol fourmilier : Fiche descriptive
Cartographie des oiseaux d’intérêt communautaire du site :
La cartographie des oiseaux d’intérêt communautaire du site est présentée dans l’atlas cartographique du Tome 1 (cartes 31 à 35) que vous pouvez télécharger ici.